neuralbioinfo/PhaStyle-TestSequenceDB · Datasets at Hugging Face

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AAGCCCCACCAAAATTACTGCCCGGCAATAACGATGCCCGTATATTCAGGAACCAGTACAGAGCAACCGTACAGAGTGGTGAA	252
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320,924

101,038

103,038

Lf2000

2,000

BASEL

virulent

1

BASEL__Lf2000__320924__1

2,000

TTGCCGAACAGGATCATCCCACGGCAACCCTTCAAAGTATACCGCAGGAACGACCTTTCCCTTCAGGAAGGATTGTCCCAAGTAGACGTTAGAATCAAGAATTTTAACCTTCATGATTGTCCTCCACTATCTCTACATCCTCACCTAGGGCAAAGTTGTAGGTCCACTGACTGTCAAAGCATTCCTGAGATGCACCAGCGGCAATAAGATCTGCCCCTTTTATTTTTAAAAGGTCGGGGTAATCTTCGTTAGGGACAGCAGTAAACACTTTCCCCACTAAGGGCTCCTGACCAATATAGAAGCTTGAATCTAAAACTTTAACTTTCATCAACGGTCTCCATCAGGTGGTTGTGGGACGTAAACACTGTTACGAATATCGTCCGCAGTATAGTAATAAGTGTCTCCAACCCTATCTCTGGCTGCAATGTACTCTGCTATACCAATAAGTGCCATTGATTTGGTGGCGTATCTTCCCCACTCGTTAGCTCCCCAGTAGAATTTAGACCAGTAAGGAATAAGACCGAACAAATATACCTTTTGACGAACTTCCCAGTAAGTGCCTTTTCCGACAAGTTTAAACTCGACTTCACTACTGTTAATCTTTTTCATTATCAATCTCCCTCTACCGTGGTAGGATTGTCAGTAAGAAATTGAGCATTGGCTGGAGGCACGCCTGACATTTTCCACACAACCATAAGTTTGTAACCAGGCACTCTATTAAGTGCAGATCGAGTAGAGTTTGTGCACGTATACTTTCGCTTTCCAAACCCGTTCTCCATCATAATCCAGTACCCAGTATCTTTGTCACCAGGTATCGGTAGACCACCTTCATCAACCCACTGAATGGACCACGGCACGATGGCTACAGCTTTATATTTAAACTTTTTAAACCACTCAAAAAGTTTCATAATTCAGCCTCGCATAGACATAATCACTATAAACAGGCAAACAATGAATCCGAATGCCACGCCACCCATAAACGTTAATATTGATGCAATCATAGTCAATCAGCCTCGCTTGGCAACTCTTCTACCTTAACATGCCGAAAAGTGTTACCGTAATGGTTGATCCATGACATCAGCTCGCTTTCTTGCTCTTCCTCTGGGATGAACTCTCGAATGCTGACAAGTTTTAAGAAAACCCAATCACAATCTGCACCCATTCTACCAGACAGGCAATAGTGCTTCATAAAACCCTCCCGCCTGGTTTAGAATATTGCTTCTTCCATTGCGCCTGAGAGCAACAAAGAGGTGATCTGGCTAACATTCATCTCAGACTCTACTTCCTCCCCTTTGAAAGGTTCGCGGCAGAATAGGACTGTTTCAGGACTTTTACTTCGAACAATATAATACAAATCATTCAATGTGTTGTAGTAATAAGTGTTAAAACGTAAGTTTTTCATTTTCTAGTCCTCTTCTTAGATTTTTGGGGAGAAACGCTTTCTGCAATACGAGACAGACGTTCTTCTGAAGCCTTACCTACTCCAGGTTTTTTGAGTGAATTATCTTTATGACCACAATCCAACTGGATATTGGATACCTCTCCAACTTTGTAAGTCAATTCTAGCAAAAGGTTGTCGTCCTTGTCAAATGTTTTTACGATAAATTTTTTATCGTTCTCCTGAACTTCATATCTGGTACCTGCAGTATACAGCATGGTGCCATCAGCATAGGATATCCAAATCATTGAGCCTCCTTTTGCTGCAACAGCATTAACTCTTTGTTAGAAATCTTTACTGCTGTTTTTATTGTTCCATCTTCACGAAACCACGACCAGAACTCTACAGTGTCACCACTATCAAGTAAAGCATGCCCATGGTAAAAATCTTTGTCCTTAGACAGTTTCTCATCTATATCTGCATCAACACATTCGTGATCCATAGCATTTTGCCTGAACGCATCGGTTATGCCAATGCACGCCTTGCTCTCAAGACTGGTATATCCGATATCTTTTAATTCAGTTTCCCAAGTCCAGTACCCTATAAAAGCTAAAACAGCTAC

182

345,276

7,732

9,732

Lf2000

2,000

BASEL

temperate

0

BASEL__Lf2000__345276__0

2,000

GTGATGACCAGATCACGTTGTCCGGCATGTTGTATCCCGAAATTACCGGCGGGGAGGTGTCGCTGACACTGCTGAACACCCAGGCCTACACCGGATGCCCCTGGCCGCTGATTGATGGCACCGGGCAGATTTACGGGATGTACGTGATTACGGGATTACAGACCACCCGTTCCGAGCTGGATCGTTACGGAAAGGCAAAAAAGATTGAGTTCTCCATCAGCTTTCAGCGGTGTGATGAGGATATGAGGGAGAAACTTCAGTCTGCTTCTGCAGGCGAACTGCTCAACAGTATGAAGAGCAGAGCTGCATCCGTTCTCAATTCAGTTTTGTGACCCGAAAAAAAGCCCGCCGCCCAGTCCTGACGGCGGGCATACTGAACACCCAGCCAGTGTGTCTGTAAAGTGAGATTATGTCACTGAATCGTACTTGTGAAGGTTTGCGTATCGGTGTTTGTATTTTCGCCGGGAATGTCGGGCCAGATAATCGCCTCAACGTCCGCTTTGTTGGCGATGCTTGTGAAATCCAGTGCGTTCAGTGCGTCAACGTAGTCAAGCCACGCATCCAGTGATGCCTGCTCGTTTTCCGTCAGTGAACGGCCAAGCAGCAATTTTGTCTGGCTGATAACAAGCTGCTGGCGTGCGCTGTTGAGTAGCGAATCACGCCTGGTTTCCGCCGCTGCGACTGCGGCACTGCGCTGTGCTTCCGTATCCGTCACCCATGCTGTGCCGTTCCACTTCTGAAACTCCCCTTCCGGGGATAACCAGGTGACATTTTCCGGTAATGAGCCGAGTTCAGAAATAAATAACGCGTCGCCGGAAGCCACGTCATAGACCGTTTTTCCCCGATGGTCTTCAACGAGATGCCACGATGCCTCATCACTGTTGAAAACAGCCACGAAACCAGCCGGAATATCTGGCGGTGCAATATCGGTACTGTTTGCTGGCAGACCTGTATGAGGCGGAATATATGCATCACCTTCACCAATAAATTCATTGGTTCCCGGCAGCAGATTATAAATTTTTATGGTCTGTGGTTGTTCACTCATTCTGAATACCATTATGCAAGCCTCACAATATAGTTAAATGCGATGTTTTTTACGGTGTTTTCCGCGTTGCCATAAGCAGCAATGGCAATGGTGTGTGTGTGCGAACCAATAGCGAGCGTATGTGTATGCGCACCTATTGCTACTGTGTGAGTATGAGCTCCTGCGCTTAATACGCGATTACTTGCTGTCTTGCTTGTGTTAGTTGCATGCATTCCACCACCGGTACCGGGAGTTTCTGCGTACGCTGAAGTATTGTTGTAAGCAAAGTTGTGTGTATGTGCTCCGGTGTTATTTGTGGATTTAGTTCCGTAATCAAACGACGATGTGGTTTTCGTTCCCAAATCCGTACTGGATGCGCTGGCGCTGTGGGTATGCGATTTAATGCCATCCTGTTCCTGAGACAATACGGCACGACCACTGGCGGGCTTGCCCTTAATCGTCCAGCCACGCATATCAGGGATCACGCCTGACGGATAAGCGGCTGCAAGTTTCGGGTATGCAGATTTGTCAAAAGTCTGCCCCTGCATCAGGGCATAACCAGACGGAACGGTATCTGATGGCCAAGGGATCGGTGCGCCAACCGGATAAAGTTCATGAGGCGAAATATACAGCGAATAAACAGAACCGTCCGTTAATCCTTCCGGCTTATTAGCAGAATATGCTGGTGAAGTATGAATCGTTACGCTGGCGTTACTGGTATAATCCCATTGAATATTAACACCTGTGGCGTAATTACCTATTTCAACATAAACATCATAGGTATCACCGGATGTATTGACCCAGGCAAAATTTGTAAACCCTGTCGATGTGCGCTGCCATAAAGCACCAGTAATCCCCTTCGGATTACCATTACCTGCACGCAAAACAAGTTCAGATATACCTGCCTGTTGAGGTGAACCGACGTTATATCCAGCGCCACCAATCAACGTAATTGAAACAACAGAACTCGCCTGTG

183

278,671

4,816

5,816

Lf1000

1,000

BASEL

virulent

1

BASEL__Lf1000__278671__1

1,000

CATCTCCTCCACTCTGTGAACCGGCCGTTGTTGTTAATCTAACTACGCCTCTCATTGACGTTGTAGAACCACGACCATTAAGAGTTGCGCCAGTAACCGCAACAGAAGCATTATTCGAGTTAACTTCTGATTGTGTTCCTAATTTAATTACGCCTTTATATTCTTCAGTAGCAGATGAATTCATAAACGTATAAGGAGAAATTGCATAGCCTTCTCTCAAAGTTCCCTGACGAACCTGCGCTACTGTTGCTAATTGAACAACACCTTGGTCCGATTCAGTAGCTGTGGTTTCAGAAGGAGCAATTTGCGCAATTAATTTAATAGCTAACTGCTGTGTTTTTAATGGAGTCATTGCAGTAGTATCATCTGCACCAGCTAATGCTTGCGGTAGAGATGAAATTTTAATAACACCATTCGAGGATTCAGTTGAAACTCGTGTTTCAAACGCATTATTAAGAGCAACAGTAAATTTAGCTGGAGTTATAGAAGATTCATTATTAACTCCGGCAATGGCTTCATCATTGGTTGAATATCTTGTTAATCCGTAAACAGTTTCAGTTGCGTTTGGATATGATAATCTTGTTGCCAACGTTGCTGGTGTAACTGCTTTGGTATTATTAGTTCCATCTATAACTTCCTGTTCAGTGGCAAGAAATAAAATTCCCTTTGTTGTTGACGATGCATCAGGAACTCCATTTACGCCAGCAGGAGAAATGGCTGCTATAGCAGCCTGAACATCAGTAATCTCTGGTGGAAAATTCGTATCGGTAGGATCAAATTTTACATAACGAGATTCATTAGAAACGTGTTGATATGTATTATTACTCATGCTGTTCTCTCAAAATGATAAAATACTGTAGGAGTCTGCTGATTATCTAAAGTTACAGTTTGTGCGCCTAATAAATTCCATGTACCGTAGCCAGGTTTAGACTCAGAAATAATTTCCTGTGAAATAGTTATTCCATATGTAGAATATGTGCTTAATACATGTTTTTGATTA

184

187,542

67,886

68,386

Lf500

500

BASEL

temperate

0

BASEL__Lf500__187542__0

500

CTGGTTTTTTCACGAAAAAAGACTACTGCGAAAGCCGGGTAAATGAGCGCGAGAAGGACTCCCAACAATACAAGTATTGTGCTGTTAGATGAGATCATATTTGGCAAAAGCCAAACATACAGAACCAGTGACACAATCAAACAGAGGACGGCATAAATATATAACCGCACCCATAGCGTTCGACATTTGTTCGGATTGTTCTGCATCCTCTCACTCCATTATTTAACGAATAAAAAAGCTGCGGTGCCGGGTTCCTCCCGGTGTCCTTTGGCTGGTTATCCACCGTGGACGTGGAAACAAGGAGAAATAATGGACAGATATAACCATTTCCCCGCGTGCGCTTAGCCGCATTCACCGCAACGGAAAGAGCATTCTTGGTGGACCTGTAGATTGGGATATGAACCCGTTACAGGAGAATGCTCTTACCTGTTACGTGCTCCGTTTCGTGGAGCTAACGGCGGGTGATCAGACCGCACCAGACTGGACTTATTTCAGCGTTA

187

171,342

42,902

43,402

Lf500

500

BASEL

temperate

0

BASEL__Lf500__171342__0

500

GTAACGCTTTAATGTCGCCAGCTTTAAATCATTTCCGCGCTGCTCCAGCTTTGTTACTGCTGGCTGACTAATACCCATCGCCTCAGCAACCTGTTTTTGTGATAACTGGAGTTCTTCACGCATCATCTGCAAGCCGACCTCAAGAATCATCTCATCTGCCATTTCTTTAATTCGCGCCTGGCTTTCAGGTGAACGGCTGGCAATCACCTCATCTAATGTTCTCATTACTTGCTCTCCAGTGTGTTCAGATGTGCTGCAAACTCATCCTCAGCTATACGCACCAGTTTTTTATAAAACCGCTTATCGTTACTTTTGTCTCCTGCACAAAGAACGATAGCCCGGCGAATCGGATCGAACGCATAAAAGGCTCTTATCGGACGGCCAGAAAACTGAACGCGAAGCTCTTTCATATTTTTGTACCGAGAACCTTTTACGGTATCGGCATATGGCCTGGGTAACTCAGGTCCGTAAACCTGTAGATTTTTCAAATCAGCCAAAAC

190

341,720

56,015

58,015

Lf2000

2,000

BASEL

temperate

0

BASEL__Lf2000__341720__0

2,000

CACCCGAAGAGACAATTACTTCTGGAACCCCATTGAGATGCTGGTAAAAGCGTTGGAACCACAATTCCAGATTCATACCATTGGCGAGAATCAGTTGTGCCCCCTGCGCACGTTTAATATCGCCAGGGGTAGGCTGATACTCATGAATTTCTGCACCAGGCTTGGTTATGGATGAGACTTCTGCAGCATCTCCCGCCACGTTTTTGGCCATATCCGCGATGATGGTAAATGTTGTAATGACCTTGAATTTTTCAGTTGCACTTGCCTGAAATGCGATCGAGCAGGTGAGTGCGAGCCCCCCCAAGAGCATGGTTACTTTTTTTATCGAGTGCATAATTTAGTACCTATAGTGAGCAAAATTAGAACAAACATAGCAACGGCTATGTTTTATAGCACAGCCTATACAAAATGAAAATGATTATCATTAGCAGCTTTGAGGCCCAAAACAGGGATTAGGTTGTTTCCTGCTGGCGACGCGTTATTGAGGAAAAAAGTAAGGCAGCTAGTAGGCTTTGAAATAACGTTTTGCGGTTGGCTGATGCAATTTCGAGAGTGCATGTATTGAATGATTTCTAGCCGTTACTGATTTTCGTATTTTTTGTATGGGAGGATTTGCACCTCCCCCCACCGAGCCTCCATGACTTTACTCCACTGTCTCTAGGGCTGCTGTGTGCCAGGAGCGGAAGCAGGGGGGCCAGAGACTCCTTAAAAGTTGATAGCTCGTTTTGCAGGGAGACTTACACGGTAAGCGTTATTCCGAAGAGCTTAAAATTGAAGCAGTCAAACGGGTTGTTGAGCGTGTTTATGCGCTGCCATCTGATTAATCGACGGAAGCAGTTCCGTTTGGTCTATGATGCAGTTGTCCGGCAGGCGCTCTGTGACGCAAAAGAACGATAGGAGTAGCATTGAAGTGAACGAGGTTATGCTTGTCTTATATTATCCTCTATTTTAAAAACATCAGCTGGTTGTGTAAGAGTTTTTATTGTTTTATCTTGTTGACTTTGCTTTTATGAAAACAGAGTGATTGATACAATGAAAACCTTAAGTGGGAAAGAGTTTAGGAAATTATTTAATCGTTATGAGACAGGATTCTATCTAAGTGAGTTTGAATACTTAAAGGACTTTGATCCTTTGTTTCCTGAATGCGTAGGGAAAGAATTAAAGTTGGGTTATAAACGAAAAGTTGATGTATGGTGCGAAGAGGATGCTGCGCTATATGCAGAATTTATAGCTACAAAAGAAAGGCTGAAAAGAGGCCGGTTAATCCTAAAAATAAACCAAGTGTGGTCGCGTGTATATCCTGCTTATATTTATGCAATTGAAGAAAGAATAAATGTCAGGGCAAAGGGGAGAGAGTCATTTAAGTATGAAACTGTGCAAGAGAAACAATGTAAACTTTCCATAATGTTAGATGGTCTGAAAGACCTTGAATGTGAAATAGCTATGATTTCAAGTGAGTTTGAAATTGAAAAACACTCTATGCACTATTTTTATATGATTTTTGATATTGAACGCTATATAAATGACTGCAGTTACTTTGTTTTTTCTGCTGCTAAAGTTGTTAAAGGCGTGATTCAATGCATTGGTTACATTGACAAAAATAACAAAGCAAGTTGCGATGAATTTTATTCAGGCAGCTATGAATGCTTGGATGATGATCAGGAAACACTGAACTATTTAAATGAATCATGCGCAGAGGGTATAGACGCTGATAAAGATCTCATCAGGAAGAATGAGTTATTAGCCTTATCCCTGAAGGAATTGTATCAACTTCTCGTTTCAAAAAAATAACAAGTAATACGGCGAGCGATATGACGTGCCATGGGATATCCGCACCCAGCAGCATGTTGTCTCCACGATGTCCGCAGTTCGCTCATAATAGACATTCACTACAGTTATAGTAGAAGGTATGCATGCTGCTGAGTGGGGAAAGTGTGAAAGAAAAGAAGACAGCTGCTTTGTTTGTCGTCACGTTTATCTTCATTGGCTATGCAAGTCGT

192

356,015

43,047

48,047

Lf5000

5,000

BASEL

virulent

1

BASEL__Lf5000__356015__1

5,000

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

194

195,208

11,299

11,799

Lf500

500

BASEL

temperate

0

BASEL__Lf500__195208__0

500

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195

176,868

16,197

16,697

Lf500

500

BASEL

temperate

0

BASEL__Lf500__176868__0

500

GTACGGTGGCGGTGGTGCGGCGATACTGATCCGGCATCGGCAACTTATGGCGCAATACGTACTGACCAATGCGCAGGGCTTCGGCGATGTTTCCGCAGTCACAACACCAGATCATGACGGTGGTTAACACGTCGTCAGACTGGCCGGAATCTGCCGTAAGTACGCCTTCGATCCACGGCTGATAATCCGGCAGCAGTTCGCGTTTTAAATCCGCTTTAGCCTTCTGGGACTGGACACGGCTCAGACGGGCTTTATCCAGTCGCAGGCGGTGAAGCATGGTTTCGTATGCCGTCATTTCAAGCTGCGACGGCTCACGGCTGGCGTGGCGGCGTTCAGCCATCACGCGATTAAAATGCTGTTGAGCAGGTGTCAACATGATGCCCCCAAAGCGGCCAGCAGTTAGCTGGCCTGCGCTGATTTATGGTGCCGGTGCTGGTTCGGCGGCGGTAATGCCTTCGATCAGACAGCCGAAGCCGTAATCTTCAACAACATAGGCATCA

197

169,215

611

1,111

Lf500

500

BASEL

temperate

0

BASEL__Lf500__169215__0

500

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198

95,101

111,479

111,979

Lf500

500

BASEL

virulent

1

BASEL__Lf500__95101__1

500

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200

106,431

8,324

8,824

Lf500

500

BASEL

virulent

1

BASEL__Lf500__106431__1

500

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202

275,748

15,143

16,143

Lf1000

1,000

BASEL

virulent

1

BASEL__Lf1000__275748__1

1,000

TACTGGGTGGGTAACATGGGTGGCAAGATGGTTCAGGTCGCTGATTATTACGACAGGTCCGGGACCAAGGTAGGGCAGAAAGTCCGAGACGCTGAGAAGAACTTCACGGCTATAGGTAGCGTCAAGTCTGACATGCTGTTCGGCTCTCAGCTCTGGAACGGTGGTAAGAAGATAGTCATCACCGAGGGTGAGATAGACGCTCTGTCTGTGGCTCAGGTGCAGGACGGGAAGTATCCTGTGGTCTCGCTTCCGTTAGGCGCCAAGTCTGCGAAGAAAGCGATGGCAGCTAACCTTGAGTACCTCGACCAGTTCGAAGAGATTATCCTGATGTTCGACATGGACGAACCGGGTCGTCAGGCCATTGAGGATGCAGCTCCAGTCTTACCAGCAGGTAGGGTCAAGGTAGCGTTCATCAACGGATACAAAGACGCCAACGCTGCACTTCAGGCCAAGGACTTCAAGGCTATCACCGATGCAATCTGGAACGCTAAACCTTTCGTCCCGGCTGGCGTGGTATCAGCGGCAAGTCTGAAGGACCGCACACGAGGGGCGATGCTTAAAGCAGAGACTGAAGGCCTCATGTTCTCGTCATGCGCAACACTCAACGCGATGACCTTAGGTGCTCGAGCTGGTGAGCTTATCATGGTGACTTCAGGGTCAGGCATGGGTAAGTCTACCTTCGTCCGTCAGCTCCTCTTAGAGTGGGGCAGACGCGGTAAGCGTGTGGGTATGGCTATGCTTGAAGAGGCTGTAGAGGAAACAGTTCAGGACCTTATGGGTCTGGACAATAACGTCCGTCTACGCCAGAGCAAGGAACTGAAGCAAGCCATCTTAGAGGATGGACGGTTCGACGAATGGTATGACAAGCTGTTCGGAGACGATAAGTTCCACCTGTACGATTCATTCGCAGAGTCGGAGGAAGACACCTTGTTTGCCAAGTTAGCCTACATGGTGGATGGTCTAGACTGTGACGTCATACTGCTAGACCACATCTCAATCG

203

258,075

49,802

50,802

Lf1000

1,000

BASEL

virulent

1

BASEL__Lf1000__258075__1

1,000

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205

339,655

15,909

17,909

Lf2000

2,000

BASEL

temperate

0

BASEL__Lf2000__339655__0

2,000

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206

246,043

126,438

127,438

Lf1000

1,000

BASEL

virulent

1

BASEL__Lf1000__246043__1

1,000

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208

177,309

29,656

30,156

Lf500

500

BASEL

temperate

0

BASEL__Lf500__177309__0

500

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209

341,097

5,841

7,841

Lf2000

2,000

BASEL

temperate

0

BASEL__Lf2000__341097__0

2,000

AACGGTGATCCGGTGGTGCCGATAACGTCCATTATGTTAAATAGCCCCGTTTTTCTTGAAATTATAACTCACAGGTTATATAGTTAGTGATATAAACTACAGGTTATAGGATTGAGCATGTGGACGGTACTTTTTAGCCAGCGATTTGACGACTGGCTAAATGAGCAAGAAGACGCTCTTCAGGAAAAGGTTTTGGCTGATTTGAAAAAGCTACAGGTTTACGGACCTGAGTTACCCAGGCCATATGCCGATACCGTAAAAGGTTCTCGGTACAAAAATATGAAAGAGCTTCGCGTTCAGTTTTCTGGCCGTCCGATAAGAGCCTTTTATGCGTTCGATCCGATTCGCCGGGCCATCGTTCTTTGTGCAGGAGACAAAAGTAACGATAAGCGGTTTTATGAAAAACTGGTGCGTATAGCTGAGGATGAGTTTGCAGCACATCTGAACACACTGGAGAGCAAGTAATGAGAACATTAGATGAGGCGATTGCCAGCCGTTCACCGGAAAGCCAGGCGCGAATTAAAGAAATGGCAGATGAGATGATTCTTGAGGTCGGCTTGCAGATGATGCGTGAAGAACTCCAGTTATCACAAAAACAGGTTGCTGAGGCGATGGGTATAAGCCAGCCAGCAGTAACAAAGCTGGAGCAGCGCGGAAATGATTTAAAGCTGGCGACATTAAAGCGTTACGTTGAAGCTATGGGAGGCAAATTAAGCCTGGATGTTGAGCTTCCCACAGGAAAACGAATAGCGTTTAACATCTGATCAGAACGAATGATAAGCCCCTGTTGCAAAGGGGCTTTTTTGTGCTCATAGAATTATATAATTATATATTTATATAAAAAGTGCTTTACAGGTGGGAAAAAAATTCCTAAGGTTATACCCGAAACCGAGCGATACCCGCCCTGGTTAAACCGGAGATAACCCGATGAGCATGATTAAAATCCGCAAAAACGCTTTCCTTAAAATTCAAACTATCCTGGCTGGTTCTGTTGGCGTGATTTGCCGTTCTTCCTCAAGCCGCATCGATGACTGCTACGATGATGAGTATCGTGTGTCCTCATGCGATGAGGCTTTAACCTGGCTGAAGGAGAATCAGGAACGTGCCCAGGTATATCTGGAAACAGAGAACGGCAATCAGATGCTGCGTATTAGCGGTCGTTATGGATTTGAAACTACATTCATGGCCTATTTTAATCAGGCTTACTTTGACAAGGAGTTGGCCTGGTACACTGATCGCATGAGCAAAAGCGAGCCAGCCCCGATTACACCGCCGAACAATAAACCATTTTTATTCCTCGTTAAGTAAACACAATGCGCAAAGTGTCATTTTGACACTTTGCGAGTGTTAATATAGGGGGCGTTTGAAGATAGATAACTTATTGTGGGGCAAGCCGATAACTTACATTGGGTTAGCTTGAATAGGTAGTTGGTATTTTGAGCATATGGCCAATCTCTTCGAGATGCTTAGATGGATTCTCCCCAGTCTTACCTTCATGTATTGACGCTATATAGTTCAAATTTTGAGCTGCCCCAAGAATCTCGGTGGCTGATGGAACAAGACGAAAGCCGATATGTAACTTTTTGATATAGAAAGGTAAAGTGGAATATTTCGCCATTAACTGTGCTGCGGAATCTTTTAGATCATGAATGATTTCTGGCTTTAAGTTCGAGCCAGGATTCACTATTTTTGCTTGGTTACATAATAACAGATTGGATATTTTCCCTAGTTGTTCCCTGAATGAAATGTAAGGCTCAATAGCTCCTTTGACGATGAGTTGGCCTAGAACAAAAACACTTACACCAGTGACCACGGTGACAAAAGCAGATGAACTCATTTTTTACCTAAAGCCTAAAGATTGGATTGTTAATACATCTTATTTTGTCGTGAGTGGCTATGTCTAATTTATTGAATATCTAGGGAAAGGTAGAGGATGTAATGACGGGTTACGAATTGAAATTATGGCGTCGTGGGATGAACTGGACGCAGGAGCGAGCAGC

212

250,042

62,795

63,795

Lf1000

1,000

BASEL

virulent

1

BASEL__Lf1000__250042__1

1,000

CCAGAGTTGCCGATTCAAACACAACACCAACTGGCATACTAGGTGCCATATTACGAACGTATCCACTCTGCATAGACACGGCTCGAGAGTATTCAGAACCGTTAGAGCTTTTGTTTACCTTCATGTAAAGGGTTTGTTCTTTATCTTCTTTCAGAGTAAAGAAAGAGCCGGGAAGAAGCCCCTGAACAGTCAGAGGGATATCTGCAACATGAGTCTTATTGATAGTAAGAACTGTCATTGCTTATTCCTTAATAGTTGCTTCAGCTTTAATAGGAATAACAGCAACATCTTTACGAGGTGCTGTCGCTCGGCCCGTATTAAGACAGGCTACAAGTCTGTGCTCATCCGCACCCTTAATACAGAGTCGAGTAGAGAACTCGGTAGACAATAAGATGTACAAATCATCATCTTCACTATTAGGGAACATGAAGCAATCCCCGAGTCGTAAAGCACTGAGAGGTATTGCATTCTTACCTGCTGGTTTGTTAACTTTCATTTAACCACCTTTAGTTATGGACCGATTTATGAGAGAACTCTTGGAAGAATGCTTTCATAAATAGGGGGAGGGGACGAATCCTCCCATATCCTATTAATTAATATTGCATGTAAGATCTAACAATTCGATGCTGTAGTGGATAGCGTAAAACGCTTACCGGCATTAAACCCAGCCCATGAGGGGCTTATGTGAATAAAATGCTCAACATTGAGCGGTTAGTTGATAGGAGATCTGAAGTCCTATCTCAAAGGACTCTCGTAAGAATCCTTCACGATATTACTTAGTAACAAAGACTGTCACCTTATCCATTACCCAGCCTATCAACATAAGTAAAGGTAAGAAGAGGATAAAGATCAGCATAAAAGGCCAGAAGAATATCACCGTCCAAATAGAGTATTCATCAGGCTTACCACTCCACGAGGAATGGAAGAAGTTGTAGAGTGTATTGGTTTTGAAGCACCACTTAACTACAATGGCTGCCAACCACCAACCAATAACATAAAT

214

100,446

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50,587

Lf500

500

BASEL

virulent

1

BASEL__Lf500__100446__1

500

CTTTCCTTAGCAGGCCAGAATGAATAATGAGCAACGCCATCAATCATCACTGGCTTACTGGACAAAACATCGCGATCAAACTCAGGCTTTAACCAATCAGGAAGAGTTTCGCGATATTCCTTAGTAACGAGCGCTGGAATACTGACCACCTTAAACTGGATGCCGCCCATGCCGCCGTTTGTCATGAACCATGTTGAATCATTGACGTGTAGACGTTGCTGAACCATCACAATTGGCGTAGTGTCTTTCATTCGACGCGATCGCACCGTGTTCTTTAGGCGCATGTGTCCGGCTTCGCGCTTCACCTTAGAAAGCATGTCATCCGGCTTGTCTGGATCATCAAGAACCAACATACCAGTAAAACCATCGTCCATGTAGCCGCCACGCAGACCAGTAACCTGACCACCAATTGATCGCGAGTTAACTTGCAATTTAACCTTGCCGCCATCGGTTACAATCAAATCCTTTGCGCTCGCCTTTGCCAGCTTTCCAGGCCATAG

216

183,468

31,232

31,732

Lf500

500

BASEL

temperate

0

BASEL__Lf500__183468__0

500

TGGGTGACGTCTGTCAGTCAGTCTATTGATCCGCTGGTCCAGTTCTCCCGGGAAACGGGGGTGGCGATCGAGACCGTTCAGTCACTGGGTTACGCGGCGTCTGTAAATGGCTCAAGTGTTGATGCGTTGCAGGCTTCGCTAGGTGAGATGACAAAAAGAGTGGGGGAGTTCGTTTCCACCGGTGAGGGGGAGGCGAAAGACGTTGCGGAAAGGCTGGGCCTTCAGTTCAAGGATATGAACGGGCAGGTAAAAAACTCCGATGTGATATTTCGTGAACTGGCCGACAAACTGCACGGCATGAGCCAGGCAGAGAAGTTTTCTGTTCTGGATAAGATGGGTATCGACCGTTCCATGGTGCAGTTGCTATCCATGACGGGCGAAGAAATATCTTCGTTGCAGAACAAGGCCGAGGCGCTTGGTGTTGTCACGCAAGACCAGGCCGATCAGTTTGCAGCCTACAACGATTCTCTGACAACGCTGGGGAAAGGCTTTGATGGTAT

217

182,974

32,489

32,989

Lf500

500

BASEL

temperate

0

BASEL__Lf500__182974__0

500

GATAAGGCGCAGTTAAACCAGCTTACGCTGTCTATTAAAGCCATTATCGCTGCGAATGCTTTTTCCCGGAAAAATAACCTGAAAGAAATTGCTGATGCCGGTGCGGAGGCCCAGCGTCTGGCCCGTGGTTATCTTGGTCTGGGGACGCTTGCCACAAAAAACAGTCTTGGTCCCGGTGACGTTAATGCCCTGGCGAAGGATCAGAATCTCGCCGACCTGGAGAATAAGGGAACCGCCCGTAATAATCTTGATGTTTACAGCAAGAGCGAAGGTGATAACCGTTACCTGCGCAGGGAACAGAATGGTAAAGATATTGCGAACAAAAGTGCCTTTATCGATAACCTCGGTTTACGGGAAACGGTAAACAGGGCTGCAAATGCCCTGCCATCGAATGGTACAGCCGTAGCGGCAAACAAGCTGTCTGCGGCATGTAAAATTAACGGTGTTGCGTTCGATGGCACAAAGGACATCACTATTACATCCGGGATGACCCAGGCTAC

218

261,104

27,627

28,627

Lf1000

1,000

BASEL

virulent

1

BASEL__Lf1000__261104__1

1,000

ATCTAGGGTCACGTAAGATTATTATTGTAAACGGTGTGTTTGGATCCGGTAAGACATTCATGGCATCTGCATATGCAGGTGATCTTCTGCGTAAGAACGAGATTGATAAGATTATTGTTGCACGTCCTTACGTTCAGACAGGAAAGACTTCAGGATTTAAACCTGGAAATGCAATGCAGAAACTGTGGCCCTATCTTCGAAGCATGATGGACACGATTTGTCGTCGTGTTGGCAAAGGTGCTTTTGCCGCAATGCTGGGAGACGGTCAGAACAGCCGTATCGAGATTTGTGAAGTTGAAAGCATTCGTGGTCGTAGTTTCGATGAGCGATGCTTTGTCCTGATTGACGAGGCACAGCAAACTAACCCTGAAGAAATGTTGTCAATTATCACAAGGATCTCTGATCAAGCCACCCTTGTAATTATGGGTGATAATAGCCAACGTGACATCCCTGGTAAATCTGGCCTTGCATGGGTGACGGATTTCTTTACTCGTCATCCAGATCCTGAGGTTGGAATGATCAGCTTTGATAGTCCAGACGATGTCGTTCGTTCTGGGTTGGGTCGTCAGATCGCACTCAATCTTATTGAGGATCGTGCAAATCATATTTGGACCCCTGTTTCCGAGTAATACAGAAGGGTGGTTATTCCACCCTTAAATATCTAAAACAGTTGTTGACAAATAGGTAAGCTTTAGATATTATTATCGGACAAAACAGAGAGAAGGACAGTATGGCTACAATACAAGAGAAACTGAATAAAATATACTGCCTGTTTGTCTATAACGGCGAGACAATTTTGGCAAATAAGGGATCCAAGAATGTGTGGATCAAGGACAGCGGTGGTAATATAATCAACTTAGCGTTGCTACGTGAGCGCCGACACAGATTCTTTATCGAGTCTCGAATTATTGAAAGCAGCACTTGCTACAGAACAGGCGATAAAGTAATTGTTGACAATGATACGTGGTATGTGGTAGATTGGCAATCATTGAGTTGTGAT

219

287,574

7,821

8,821

Lf1000

1,000

BASEL

temperate

0

BASEL__Lf1000__287574__0

1,000

ATCAAGGATGATATCTAGATAGCTAATATTTTGACTGTGATCAATATTATCAGATGCTCTGGTTAAATTGATTAATCTTAGGCGATCAACAAAAATAGCATCGCCTAACTTATTTTTATGCGCCCACTCACCATCTATCCATCGTAGATCTTGAGGTAAGAAATAATAAGTTGCCCATCGGTGAGCTACGGGGAATTTACTGTAGAGCATCGCAGGTGAGGCCTCAAGCTGCTTCGCTTCCCACTCTTCTTGAGAACAGCCACACTGAACAAAAGAAATAGGGATGGCATCTCGTTGATCTCCCATTGGATGCCAGGCAATTATGTCAAGGCCTCCGTCACCACTATTTCCTCGACTGAAATCTCGTTCTTTGAAGTTCGCTGTGCAACGGATATCGGAAGCAATACTCTTAAATTTATTATATAGAGTTCCAGTGTAAGGGGCCGCTTGACCACCAGAAGCCCAGCATGCTTTTATTATGCTACCGCTAGGCATTAGGCTTTCAAAAATAGGTAAACTAATTAGTTCAAAACTGCGCGTTATCTCTCTTCTGCTCATTATGTTGACATATTTTATGTTAGCACAGATTAGTAAAGCTAAATATAGTCTTTCTAAATGTTCCAGTGGCTTTTCTGATATATCACGTAACTCTACAGTATCGTTGTCTTCTGATAAAGTAAAAGGGTAACTATCCCCAAATAAATCAATGCGTTGTCGTATGAAGCCTATCGCATAGCTCCACTTTCTGTCAGTATATGCTCGACTAACACTTCGTTTTGTTCTCTTGCGTACAGGCGTATCATTTTCATCATCAACATCATAAACGCCCTCTTCTTCTGCTTCATCTGTTTCAGCTAGTACTGCTTCGGGTTGAGCTTGCAGTGTGCTATATAGGTCTCCTCGACTGAATGACCTGTCGATATTAGTTAAGGCCAATATCTCAATATAATCAGCCCATAAATAAGGCTCATTAGAAGGCATTGAATCAAGATTTGTAATC

221

246,728

28,982

29,982

Lf1000

1,000

BASEL

virulent

1

BASEL__Lf1000__246728__1

1,000

TGTTGGATCTCCTTCTCGGAGTTCTTTAGCGGGGCGTGCTGCATAGTGAAGCTGCCTGGCTTAACAGGCTTGCTAATAAACCAGCGATCGGTGAATGCCTTATAGCTACTGCCGAGGCGTTCGCCACCGTCGACAAACCACGTCTGACCCCATAAGTCTTTTAGCCCGTTTGGCGCTGGTGTGCCGGTAAGGTTAATCCAGCGCTTGACGTGTTTATGTGCAATCGCTGCCAGTGCGCGGGCGCGCTTGCTCCCCTGCTTGCTACGATAGCCTTTCAGCTTAGTCGATTCATCGGCAACAACGACCGTAAAAGGCCACTCGTCGCCGCAATACTCGACAAGCCACTCAACAACATCGTAGTTGACACAAACCACGTTAGCGTTGCTCTCAAGCGCCGCAATGCGGTCCTTCTCTGGCCCGGTGCCGTCTACTACAAGCAGGGCGGGGAATCTCCATTTTTCTTGTTCCGGGGGCCACGTGCCGGACGCAACGCGCAGCGGGGCCAGCACCAGTACGCGGTCCTCCTGGTTGGACAGGATGCCAGTCTGGAACATTTTGTTTAGCGCCCACATAGTCGCGCCAGTTTTACCGGACCCCATTGTCGCCCAAATATTGCAGCGCTCATGCTTGAGAATAAACGCGGTTATCAATTTCTGATATTCGCGACGTCGGAATCGTGCCATATCTTTATTCCGCCTTTTTCCAGACTTCGGTTTCACTGTTCCAATTCCTCTTTGTGGCGTCGTAGTTGGTGGCGTGTCCAATGTGCACACCGGTCGCGCGGAAGCTCTTAAACTTCTGCCAGCACACTGTCAACGGCAGCGGGTAATTCATGCCTGCGATAAACCATACGCGATCGCCAGGTTTGCACTCGCCCAGCTTGGTGAGTCGGTAATGTTCTTTCATCGTCATGCCTCCAAAAATGGCGGGACAAGCCCGCCGTATTGATTATTCTTGTTCTGCGCGATAGCGGCGCTGCCGATCACGTTCTTTCTTATTG

224

162,860

12,774

13,274

Lf500

500

BASEL

virulent

1

BASEL__Lf500__162860__1

500

GATAGTAACGGTGAGCCGATTACTAAAGCTGAACCTTCTACTACTGAACCAGGCCAGGAACAGGAAGAAGAAGGCAAACAGTCTGAAGGTCTGCCTGCTGACTTCAACTATAAGGAAGGTTACGAAAAGTTGATGGCTCCTTTTAAAGCTAACGGCAAAGTGATTACTCCCCGTTCACCGGAGGAGGCCATTAGCCTGATGCAGATGGGTGCTAACTATACTCGTAAGATGCAAGAACTAAAGCCTTACCGTAAGGTAATGCTGATGTTACAGAACAACGGTTTAATGGATGAGGATAAACTTTCTTTCCTTATTGACCTGGATAAAAAGAATCCAGAAGCCATTAAGAAGTTGCTCAAAGACTCTGGTACAGATCCTCTGGACTTTAACCCAGATGAGGAAATTAACTACCAGGGTGGCAATCACCGTGTTACCGACACCGAAGCAGATTTTGCAACCGAAATTGACGACTTAAAGTCTACTCAAGAAGGACAAGCTAC

228

139,826

48,720

49,220

Lf500

500

BASEL

virulent

1

BASEL__Lf500__139826__1

500

AGAACACACCAAATTGTTAAAAGCTCTTAATGCAAAAGCAAATGGTTTACGTAATGCTATTGAGGTATTGAAATGAAAAAGCGTTTATTAGAAGACATTGCAGCTTCAAGTAATTCCAGTTTAATTAAAATTATTATGGCTGGTGAGGAAGATGATATGGAAATGCGTGGAAAGATTCACGGCTGCGACGATTTAGATTTTAAACCTCCAGCATGGGATGCTATTATGGCTATGGTTGAACGACGTGAAAGAGCTTCTAAAAACGTTCCTAATTGCCCTGAATGCGGTACTGAACAAGTTCAATTGATTAACTGGCGTAAACCAGAGCTTGAATATAAATGCCGTCAATGTAAACATAAATTCAGTAAGCATGCTCCGGAAATGGTTAAATTGCCTGACTCTACTGAGTTCTTTAAAGAACTTGTGAGTGTTCAACCAATGCCTAATAATATTTTGGATTAAAAATGACCAAGCGTAAAGAATATATGGAGGCTGCTGAA

229

162,283

106,623

107,123

Lf500

500

BASEL

virulent

1

BASEL__Lf500__162283__1

500

CAGAATCCTACAGTATCAGTTGTTGGTGCGCGGGTATATAAATCAGATGTTTTAGTACCCTGAGAACGAATTCTCGAGTTAACAGTTAAACCGCCTGAATTTATAGTAGCACCTTTGGCAATGATTAAGCTTTCACCAATTGTGACTTGACCGGATTGATTATTAATTGATAATGGACGTAATCCATTAAATCCACCGGTCTGATCACCAGATGCAGTAAGCATAAAATATGTGCTGCCGCCATCATTCCTGATAAAGAATCCATAATCACCGTTTATTGCTCTGAAAGCATTTGCAGACTTGCTAATGAATTCACCATTGGCTGTAACTGAACTACCAAATGTTGCTACGCCATTCGCATTCAATGAACCGGAAGCGTTAACATTTATTGGCATCACAGTACCATTAATGCTAAACGTAATATTACCAGCTTTATTACGTTGAGAATAAAAGTGATTAGATGTTTCATCACCAACTTCAAATACAGTAGAACGTGTTGT

230

258,546

23,425

24,425

Lf1000

1,000

BASEL

virulent

1

BASEL__Lf1000__258546__1

1,000

TAATGGATAGCAGGGTAGGGGGTACTAGCAAAACCTGGGAAATGCCTACTGTCAGTGGTACGCTTCTTAGTAGTGCGGATATAGGAACTTCAGGAGCTAAAATCCCTTTACTTAACGTTCAGAACATGTGGACAAAAACTCAGGTTTTCCAAGAATCAGGTGTTGTCACTCAATCGGTGCTGCCATCGGATGCTACTTTAAATGATCACGGCGGTCCTCATTTTGTTTCATATGTTATAACTGATAATCAAATTCGTTTAGGCGCTAAATTCTTTTCTAGTTTTGATTCTACGAATTTAAGAAGAGCCGTTGTCCAAGTCACAACAGATAACGATGCTTCCGCCCAGATATTTGCATTTGATCAGAGAGGGGATATTTCATCTGCGAAAGGTATTGTACAGTGGAGTGGCTCTGATACCCGTATTAAGACTAACTTTGAACCTGTGCAAAGTGGGTCGTGGGAGCGTATTTCTAAGATTAGTATCTGTGAATATACCTATAAGGTAAACCCTACTCCTCAGCGTGGGTATCTCGCTCAGCAAATGAGGGAAATAGACCCGTTATATGTCTTTGAAGGGGGTAGGTCTATTGATGATAACGGCAAAGAGTTTGAAATACTAAACGTGAACGATAAAGCTGTTACAGCAGATTTAATCATAGTTGTGCAGCAAATGCAGGAAAAACTAGCTGTGCTTGAAGAGCATAATAAAAAGATTATCCCCTTAGAGGAAGAAATAGCTACTTTAAAAGATGAAGTTAATACTCTTAAAAAGTTACTTGTAGAGATTAATCAATCATTAGCTATCACTAGTCGTGTCTCAGCTTTAGAGTCCGAAGTTAATGAATTAAAACGTCCTTAATAATTATTAGGTAAATACCTGTGAGATATCTCACAGGTATCCCCTAGTACTAATTTATTAAAAAAGTAAAGAAGATTATAGTATATACTACTAGGTCTTTCTAGGAAATACTATGTCACGTAATTTAATGCCTAAATCCG

233

140,988

61,633

62,133

Lf500

500

BASEL

virulent

1

BASEL__Lf500__140988__1

500

GAAGCTGCGTGCTTCTTACGAAAATCGTATTATGGAATTGGAGGAAAAACTTTATGGACTTCTTGAATCAGAATCTAAAAAGTAATTTAGAAAATATGCTTATGGAGCAGTGGAATGCTGGGTATAATGCTGGAGTAGCTACCTGTATTGCTGGTTTGGATATGCTTATTAAGCAAGAGAAGGTTCGCCCAGAAGAAGCAATTCTGCTCCAAAATATCATCGAAGGATTCAAGCAAGGAATCGTATAATGCGTAGACTAATTGTTGTTAGTGGTGCAGGTTTGAGTGTAGATAGTGGTGTTCGTGCTTTCCGTACTGATACTGCTAGTGGAAAATCTTTGTGGGATGAGTACGATCTAGAGGAAGTATGTAGCTTGCCTAACTTTGAAGCTGGCTTCCGTCGCTTCTGTGGTGAAGATGATCCTAACTACTTCAGCGCTCGTTTCCCTGGCATTGATGAAGATGGTAACGATCTGTATCTCAAGACTCATGAGTTCTACA

234

113,362

112,128

112,628

Lf500

500

BASEL

virulent

1

BASEL__Lf500__113362__1

500

TTTTTAACTAGTAGAGACACTGTATGGTAATGATGAAGCTCTAATTCTTCACCACAACCACAGATTTCGCAGCGATCGGCTTTTTTATATTGACTTTTTATACCGTCTCGCATGAGTGATATAGCATCACGTTTATATTTTACATTTCCTGCCACAGTATTCTCCTCAACTGTATGAATATAGTATACATAATCATGTCGAATTTGTAAAGGGGATTTTAAAATGCAGGAATGGGATACCAACTGAGTAGTATCCCATCCTATACTTATTTATTTCCCACGGGAAATTGAGTAAATTCCATAACGCAGTGCGTCACAAAGGTGAGAGTTCGCATCATGACGTGGTTTTTCACGTGATAATTTCTCTTCGCCCTCCTGGAAGTCCCACTTGTAGTTCGCTAGGGCGTGGATCAATGAGGTACATGAAGCATCTACGATGATCTTACCTTGCTGGAACAGTGCTTGTAGGCATGCCAGACCATCTAGGACAGATTTCTTAGC

237

166,295

12,842

13,342

Lf500

500

BASEL

temperate

0

BASEL__Lf500__166295__0

500

CCACGGCATCGTATTACCGGTTTTAGCGTTGGCGTTATCCGGTTGTTTCTGGAACGCAACACTGCGTGCCGTGATGATGTCGCCGCTGACCTTGTTGCGGATCACGATAACGTTATTCCCCCATGTGGCAGAAGACTGGCTCTGTGCGTTATACGCCAGCGACAATTTTTTATTTGTCGGTGATGTCTTCAGAAGGTTAACGGTAATCGTCCCGCTTTTATCTGCATGGAGACTGTGCATCACTTCGCCATCAGCACCGATGGTCATGGTGTTTTTAGGACCGCCCATCGCAACCACAATCCCCTCTTCAGAACTTGCCGAACCGTACCCGAGGTCAATCGAACCTGTCGGCCCGGTCAGCGTCGCAGTGACATCCATAAAAGAATAGGTAGACATTCACTTCCCCTTAGCGAACAACGTTAATCTGTACGTCAGCGTAATGAACCGCGCCTGCAAGTTTTATTGCAGCCTGAATCACCGGAGCCTTACGGGCTTCACGT

239

162,313

114,586

115,086

Lf500

500

BASEL

virulent

1

BASEL__Lf500__162313__1

500

TTCGTGAGTATAAAGAACCGACTTCTGAAAAAGATGAAGTCAAAGACAAGGTTTCTGGCGTAACAAAAATTCACTGTATTGTTGACGAAAACAATGTAGATGAAATCATTGAACTTTTGCGAAAAACTTTTAAGGCCTAATATGACTAAAGATGATTTCCTGAATGCGGTAGAAAAAGCTAGTGAGAAATTTGAAGTGATGGGTGTACGGGTCCACAAAGACAGAAATTACGGGCTCGATATTCAAACGTATTCGTTATGGCTTGTGGGTGAACACAGTCTTGTAACCAGTTTAGTTATGGGTGTCGATACCTATCCTCTATTGGTTAAGTTCAGAAGTATGGAAAAGGCTACTAAAGAAATGATTAAGCTTGGTAAGTGGCTCGATAAAATTCAAAAATAATTGTTTACAACAGGCTATGGTAGTGATACTATAGCCTTATCAACTAAGGAGAATAAAATGAGATTACAACGTCAGAGTATCAAAGATTCAGAAGTTAG

242

133,933

93,642

94,142

Lf500

500

BASEL

virulent

1

BASEL__Lf500__133933__1

500

TCCATATTTAACACCTCTGGCAGGTATGATTCATCGAATTCAAGGTAAATCAGGCCACGAGTGTTGTCAGCTCCACCAAATATTTCTATCTTCATGAAATCTCCTCTGGAAATGAGAGTGTGAACAGGGTTTTATACGTTCCGATGCACAGGAATTATGCACGTTTGCCTCTTCAGGCCATGCTTTAGCATGAGGAACCTGTGTGGGCTCGGTGCTTCATAGTCTACCACCCCTGAACTCTTCGTGCTCAGGCATAATAGAGAACCAGATATCTACGATGTCTTCCCACGTTAGGTCATCAGCCTCAGGATCTACCTGGAGCGAAGATGGAGAATCTTCAGAATCTAAGTTTTCCTCTTTCACTGGCTCAGCCAAGGGACATATAGTCACTCCTTTGGATGTCTCTTCAGATGCATGTGTGTTTATCATGTTCCACCCGTGAGTATTCCGGCAACAGCCGCTATGGACGTAATGATCATCAGGATCACCACTAAAACTTC

244

284,371

19,676

20,676

Lf1000

1,000

BASEL

temperate

0

BASEL__Lf1000__284371__0

1,000

TCCCATGACACCTGGTTGCCGACATAAGCCACAACATCCACGGCATGCCCTGTGAGATGGCGACTGTTCATGGTCTGGCTCTTGCCTGTGGTCACGAGCTGCTTCTGACGATAACGACTGCGCAATCCTTCGGTGATACCAAAATCCACTTCCGAGATTTCCAGCGCCCGTCGGGTCACTTTCACCAGATCAGGATTTACACCCTGCAAATTCTTTTCGCTTCGGCTGCTGAATTTAAATGTGTTGCTCATTCGTTCCTCTCCTTCACCCTGCGATCAAATATTGCAATAACCTTGTCGCGTGCTTTCTCTGCGCCCATAAAACCGATTGAGGCACCAAAAAACGTCACTGCATCCTCAGGGATCCCGAAGAAGCGCAGCGACCCGGCCACGGCCATGGCAAGAACGCCGCACGCCAGCGATCCCGTTACGGTCTGAACCAGTGTTCGTCCGTCATAAAGACTCATCAGCGCGGAAATGCTGACAGCCGCGCCTACTGCATACACCGTTGGCAGGTGGTCAAAGAGCCACGCAATAACCTGCTCTGTGATCCCTGTTTGAATGGTGCTCACTGCTACTCCCCCCACAACTGAATCATTTCTCGTTTCTTCTTCTCCGGCTCCGGCATCTCCACTTCCTGCCCGGCGTCCAGAAATACCTGCTGACAGAGTCCGGGGTTAGCATCCAGCACCTTTTCGGTGACGCCCTGCGTCGTGCCGTAGTACCGGAAACAGAGCGAATCCACGGTGTCGCCTTCCAGTGCCTTCACTTTCATCAGCACAACTCCGCAAAGATTCGCGGGCGGCACAGAATGTCAGAGATGGCCCAGCTCACATCACGCCACAAATCCGATGTCTGTATATCCAGAGCATCCGCCCGGCGGTCGCCCTTGTCCGTTGTGTCTGCATCACGATAACGCTCCAGAATCAGGGCGCGTGTGGCGGTATAAACAGCATTGCGCCAGTGCCAGAGATTGACGCTTTCTCCGTTAATTACGGGTG

245

154,359

39,969

40,469

Lf500

500

BASEL

virulent

1

BASEL__Lf500__154359__1

500

GCTTACCACTGGGCCAATCTTCCATACCTTTGACTTTCCACGTCTCCGTCGAACGGCAGCAATAATGCAGCTTGCCCGGACCAGCGCCATATTGTGATCCCGCCACCACTTTCCCGCCGCGCTTGCCTTTGGTGTCGGGAGTGACGTCAACAGGATAAAACAGGCGATCGCGTAGCTGGCACATAGGGGAAGTATGAGTGTCCAATGTAGCCAACCATTGGCGACCTTCGAGAATATCGTCATTAGCTTTTACCATTAATTCGCGGGCGGTCGCCGCATAGTGGTTGACCGCGGACTTAACAACGCTTGCGATTGCTTGCGCACTACGCCCGCCGAGCGCGCGCCTCACGTCCGCGATAATTTCCATCGTTGGCTTGCCCTGGATGAATCCGGCGCGCACCTGATTGCCGATCTGCGTCCTGGTCCACTCGGAAAGGGAATCAGGCCATTGCATCATAGTATTACCCTGGAACGGGTTTTTCATTGCCGTCGCTGCAATC

248

177,395

1,915

2,415

Lf500

500

BASEL

temperate

0

BASEL__Lf500__177395__0

500

TTATGCACTCGATAAAAAAAGTAACCATGCTCTTGGGGGGCCTCGCACTCACCTGCTCGATCGCATTTCAGGCAAGTGCAACTGAAAAATTCAAGGTCATTACAACATTTACCATCATCGCGGATATGGCCAAAAACGTGGCGGGAGATGCTGCAGAAGTCTCATCCATAACCAAGCCTGGTGCAGAAATTCATGAGTATCAGCCTACCCCTGGCGATATTAAACGTGCGCAGGGGGCACAACTGATTCTCGCCAATGGTATGAATCTGGAATTGTGGTTCCAACGCTTTTACCAGCATCTCAATGGGGTTCCAGAAGTAATTGTCTCTTCGGGTGTGACGCCTGTAGGGATCACCGAAGGACCCTATGAGGGCAAACCTAACCCCCATGCATGGATGTCGCCAGATAATGCTCTGATTTACGTCGATAATATTCGTGATGCGTTGATAAAATACGATCCGGCAAATGCACAAACCTACCAACGCAATGCCGATACTTAT

249

156,144

9,858

10,358

Lf500

500

BASEL

virulent

1

BASEL__Lf500__156144__1

500

CAAGAACCATACGTTATCCCCTTGGTTTCCACCATAGGCAAACACTTCGCCTACACCGTTCGTTAAAACCACAGATGACGGAGATAGGTGCTTAAGCAGTCTTTCAGAGAGACCCACTGTTGACCCGTAGTTTGCTTTGCACTCATTAACATCATCTGCTGAAAGATGCCACAGAAAGTAGTGGACATCTGGTTCCGTAGCCTTGCGAATATACATAAAGTCTCCTTATAACCTTAAGGGCCTATAGTCCCTATAGTGATAGTTAAGGTAAATCTATAGGCCCTTCAATAAGTTAGACGGAACGAGCTTTCTTAGCGTATGACGCCTCCCAGCCACAGCCAACGATGGACACTGGGGTAGGATAATCTGACTCTAAGGTTAGACTCGTGGTTAATGCGTTACCATTCATAGCGAAGCGATACTGACCGTCCCCAATGTTGGTAGTACCGATGGTTTGCTGGCCAAGGGTGTACCCGTTGAAGGTGTTCACGAACTCCCTC

251

362,788

8,054

13,054

Lf5000

5,000

BASEL

temperate

0

BASEL__Lf5000__362788__0

5,000

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

252

324,487

47,260

49,260

Lf2000

2,000

BASEL

virulent

1

BASEL__Lf2000__324487__1

2,000

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254

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22,805

Lf1000

1,000

BASEL

temperate

0

BASEL__Lf1000__288469__0

1,000

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260

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25,856

Lf500

500

BASEL

virulent

1

BASEL__Lf500__109113__1

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261

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Lf500

500

BASEL

temperate

0

BASEL__Lf500__171040__0

500

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262

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Lf500

500

BASEL

temperate

0

BASEL__Lf500__168713__0

500

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265

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13,409

Lf1000

1,000

BASEL

virulent

1

BASEL__Lf1000__269799__1

1,000

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266

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22,004

Lf1000

1,000

BASEL

temperate

0

BASEL__Lf1000__279862__0

1,000

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Lf1000

1,000

BASEL

temperate

0

BASEL__Lf1000__291587__0

1,000

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268

95,415

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Lf500

500

BASEL

virulent

1

BASEL__Lf500__95415__1

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271

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Lf500

500

BASEL

temperate

0

BASEL__Lf500__196480__0

500

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273

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Lf500

500

BASEL

virulent

1

BASEL__Lf500__143144__1

500

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275

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12,597

Lf1000

1,000

BASEL

virulent

1

BASEL__Lf1000__266161__1

1,000

AGACAAAGCTGCTTTAGGTGTTTTATTTGATATTTATGGGATTACTGATCCTATAGAGAAAGAATTTGTTCTACACATTATCAATATATTTGATGCTAAAGCTGTAGATGCTGCACGTAAACGTGCTGAGAAGCATAAACCGCAAAACGGAAGGATTCCTAACGTTAAGCCACATGCTAGATCTCGTGCACGGTAAAAGTTTCCTCCAATGGGGCGTTCCACGATGAGGCTTGGCTCTGGGTGATATGCCCAGAGCCTTTTTTATTTATAAACATATAGGTTGGTATAGTATGGGAAAGAAGATTACTAAACAGGATAGAGAGTCTCAGATAAGCAACATTTGCAATGATAAAAATTTATCCTTTGTTGGCTGGATAGGTGAGTACACTAATATTAAAAGCACCCTTACACTTAAGTGTAATAAATGTTATTACACCTGGTCTCCTAGGTTGGATAACTTTTTACGGATTACTGCCCAAAAATGCCCTGCATGCGCAGGCAAAGCTAGATGGACGAAGGAAGAAAGAGAAGAACAAATAAAAAGTAAGTGTGCCGAGAAAGGATATAACTTTCTATCTTGGTCTTCCACCTATATTAATAAAGATTCTAAGATTATACTTAAATGTTTAAAAGATGGTTGTATCTGGGATGTGTCTATACACCATTTTATTAATCACGATACAGGGTGTCCTGATTGTGCTTCAGGAGGATTTAATCCTAATATACCAGCTACTTTTTATATACAGAAATTAACGTATCAAGGGACTCACTTTCTAAAATTTGGGATCACTGGTAAGGATGTACTAGAGAGAATGAGGCAGCAAAGCAATAAATCACTATGCGAGCACTCGGTAATTTTTTCTCATACTTTTTCTTATGGTTCTATGGCTAGGGGGCTAGAAAAAGTAGTAAAGGACTCAGTAAACACAGGAGTATTAGATAAACATATCCTTCCAGATGGGTACACCGAAACTTGTCACTACTCTGAGCTAGAAACTAT

278

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27,404

Lf5000

5,000

BASEL

virulent

1

BASEL__Lf5000__359823__1

5,000

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

285

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18,177

Lf500

500

BASEL

virulent

1

BASEL__Lf500__158938__1

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286

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Lf500

500

BASEL

virulent

1

BASEL__Lf500__98541__1

500

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287

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Lf2000

2,000

BASEL

temperate

0

BASEL__Lf2000__344802__0

2,000

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293

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24,247

Lf5000

5,000

BASEL

temperate

0

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5,000

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

294

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Lf500

500

BASEL

virulent

1

BASEL__Lf500__135823__1

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301

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Lf500

500

BASEL

temperate

0

BASEL__Lf500__179839__0

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303

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Lf1000

1,000

BASEL

temperate

0

BASEL__Lf1000__281939__0

1,000

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305

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Lf500

500

BASEL

temperate

0

BASEL__Lf500__174559__0

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307

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Lf500

500

BASEL

virulent

1

BASEL__Lf500__146148__1

500

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309

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Lf1000

1,000

BASEL

temperate

0

BASEL__Lf1000__288619__0

1,000

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310

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Lf500

500

BASEL

virulent

1

BASEL__Lf500__144463__1

500

AAGCCTTTACTTGGAACTAAGCGAAGCCAGTACACGATCGTAATAATGGAGATGATGCGTCGCTGTAAAGAGGTTCACGGGCATGACCTAAGAATATTTGGTATGACGGGATCTGAATTTCGCGGCGTTGTTCCTATTCTTGTTGAGAATCCAAAGGCGTTAGGATTCTGGCGCGAGCGCGTTACTGATATTGACACCAACTACCTCATTGAGTTTGGCTCTGTCGTTCCGACGATATTCGGTTCAACGGATGGCGCTCACTACGATCTGGATAAGTTCAAAGCGTCAAGCGAGGACGGCGTTCAGGACTTTACAGAGAAAGATATGAAAGCGATGGAAGATGAAATTCTTCATGACAAATCTCTGACTCAGCGAATCATGCAAATGGTCGCCAAAAAGGCTGAAGAGCGCAACGCGGTCCTGATTACATGTGCCGGGGTGCGTCACTGTAAAGAGGCAGCGGCGGCACTTCCTCCAGGAAGCACCTATGCAATCATCAC

316

136,626

38,158

38,658

Lf500

500

BASEL

temperate

0

BASEL__Lf500__136626__0

500

TTTTTTTAACTATAAACGCTGATGGAAGCGTTTATGCGGAAGAGGTAAAGCCCTTCCCGAGTAACAAAAAAACAACAGCATAAATAACCCCGCTCTTACACATTCCAGCCCTGAAAAAGGGCATCAAATTAAACCACACCTATGGTGTATGCATTTATTTGCATACATTCAATCAATTGTTATCTAAGGAAATACTTACATATGGTTCGTGCAAACAAACGCAACGAGGCTCTACGAATCGAGAGTGCGTTGCTTAACAAAATCGCAATGCTTGGAACTGAGAAGACAGCGGAAGCTGTGGGCGTTGATAAGTCGCAGATCAGCAGGTGGAAGAGGGACTGGATTCCAAAGTTCTCAATGCTGCTTGCTGTTCTTGAATGGGGGGTCGTTGACGACGACATGGCTCGATTGGCGCGACAAGTTGCTGCGATTCTCACCAATAAAAAACGCCCGGCGGCAACCGAGCGTTCTGAACAAATCCAGATGGAGTTCTGAGGTCA

318

243,863

13,524

14,524

Lf1000

1,000

BASEL

virulent

1

BASEL__Lf1000__243863__1

1,000

TACAGACTTTGCATCCCGAGGAACAATTCGTAGAACTGCAATGGGGTAATATATGCTCACTTGGCCTGAAGAGCTTAGACCATCGGAAATGGAATGGTATCTAGTTTCAAACGCTGTAGAATTTACAAGCCCCTTCAATGGGGCTTCCCAAACTGTGTCATATCCCGGATCTCGTTGGGAAGCGACACTGACATTTAGCAACTTAAATGACTGGCAATCCAGAAAGCTTGAATCAACGTTAGCTAAACTTGATGGCAAAGCTGGTCGCATTATGCTTCAGGATTTTGGTCGCTGGGGTAGGCCTCCAATGGGATTACCTGTGGTTAATGGCGCAAATAACACTGGGACAACTTTATCAACTAAGGGTTGGACTCCTGACCGTAAGGTATTATGGGAAGGGGACTATATCGCAGTAAACAATGAATTAAAATTGATAACAGAAGATGCTTGGAGTGATTCTTCTGGTAACGTGATTTTAAATATTGCCCCAATGTTAAGAAGCATCCCTCCAAACGGTGCAAAGATTGAGACTCAGAAACCACAAGGATCTTTCCGTTTAGCCGAAAACACAAATGGAGTTAAACGTCAACCTGCATTTAATAACTCCTTTACTTTAAAATTCTCGGAGGCGTTCTAATGTTATTCAGTCCGTTTAGCGATAGCCTTCTTAGCGCAATGGAGCAACCAAACGTTGCGCTAGTGTTGGCAGCGGAAATAGACTTCCCTTCCGGTATCACTCGCGTGCATACTGGAACAGGAACTGTTATTATCAATGGTCAGACTTTTCTTGGTGTAGGTACTCTAGGGGATGTTGGATCGGTTACAGAAGAAAACAGCACAAGCTCAAGCACTATGTCCATGGCACTTAGCGGTCTGGATATGAGTCTTGTAGGGGAGACGTTAAACGAAGAAGTTATTGGCCGCAATGTTATTTGCTATCTTGCGGTTATGAACGATCAAGGCGTTGTCACTGGTGCAAACGTATTATTTGAAGGGTTTA

319

283,717

24,460

25,460

Lf1000

1,000

BASEL

temperate

0

BASEL__Lf1000__283717__0

1,000

AGTCAGGCATCACAACGCTGATTCGCCGCGACGGTTTCCGCTTCTGGGGTAACCGTACCTGCTCTGATGACCCGCTGTTCCTCTTTGAAAACTACACCCGCACCGCGCAGGTGCTGGCCGACACGATGGCTGAGGCGCACATGTGGGCGGTGGACAAGCCCATCACCGCAACGCTGATTCGCGATATCGTTGACGGCATCAATGCCAAATTCCGTGAGCTGAAAACAAACGGCTATATCGTGGATGCGACCTGCTGGTTCAGCGAAGAATCCAACGATGCGGAAACCCTCAAGGCCGGAAAACTGTATATCGACTACGACTATACCCCGGTGCCTCCTCTTGAAAACCTGACCCTGCGCCAGCGTATTACCGATAAATACCTGGCAAATCTGGTCACCTCGGTTAACAGCAATTAAGGAGCCTGACCGATGGCAATGCCGCGCAAACTCAAGTTAATGAACGTCTTTCTGAACGGCTACAGCTATCAGGGCGTCGCGAAGTCCGTCACGCTACCAAAACTGACCCGTAAGCTCGAAAACTATCGCGGTGCGGGAATGAACGGCAGCGCACCGGTAGACCTCGGCCTTGATGACGATGCGCTGTCAATGGAGTGGTCGCTCGGTGGCTTCCCGGATTCGGTTATCTGGGAGCTTTACGCCGCAACCGGTGTGGATGCCGTACCGATTCGTTTTGCAGGCTCTTACCAGCGCGACGATACCGGCGAAACGGTGGCCGTCGAGGTGGTCATGCGTGGACGTCAGAAAGAAATCGACACCGGCGAGGGTAAACAGGGAGAAGACACCGAGTCGAAAATCTCCGTGGTCTGCACCTATTTCCGGCTGACGATGGACGGTAAGGAGCTGGTCGAAATCGACACCATCAACATGATTGAGAAGGTGAACGGCGTCGACCGGCTGGAGCAACACCGCCGCAATATCGGCCTGTGATTTTCATCCGGTCAGCCTGGCTGACCGGTTAACCCTGATTCAGAAGTGAGAAA

321

169,560

25,961

26,461

Lf500

500

BASEL

temperate

0

BASEL__Lf500__169560__0

500

CTCAATACCGGCAATGGTGTTCATCAGCTCCATCCGGCGAATTTCAGGATTAGAAATACTGCCCATCACCTTACTGATAAGGTCGATGCGTTCGCCGGTTTCCCTGTTTTCAAGGTCACACGATTTAAGAAATTCCAGATTTGCCTGGCGGCGCGCACGCACATCACGAATGGCGTGTTTACTGGCATAAGGAGAACGGTCTTTATTGACCTCCCCGACAGCTATCAGTAACGCTTCATGCCAGCGCATACGCTGGCCTTTAAGCTGACTAATCCACCACTCATCGTTAAACAGACGGGCAATGGCAGAATATGCCTGCCTCGTGGTCATCTGTCCTTTACGGTATTTTTTCCAGTAGAGAGGGGAAATATTGAAAGCACGTGCAGCGCCAGCAACATGACCATAGAGGTGAGCCTGCGCCTCATCCGTAAACAGCGATTCTTTTTCGCCATGCGCATCCACCCAGGCATCGCAGAGTTCCTCATACATCATGAAAAGCT

322

365,473

34,746

35,831

Lf5000

5,000

BASEL

temperate

0

BASEL__Lf5000__365473__0

1,085

CAATGGCAATTAAAGCGCTCGATGGTGGACGGTATAAAGTGGATGTTAGACCGCGTGGCCGAAGTGGACGTCGGATTCAGCGGATTTTTAAGAAAAAGGCAGATGCAGTGGCCTTTGAGCGTTATGTTCTCAGCCACATGCACGATAAGGAATGGCTTGAAAAGCCAACAGAGCAACGTCATCTCTCAGATCTGCTTCCGTTATGGTGGGAATTGGGTGGACGCAATAAGCCATATGCTAACGGCGTTCTAACCAGGTTGAAAAAAATCATCAAAGAAATGAATGATCCAAGGGTTAGCCAGATTAATGCTCGTTTCATGGCAGCTTATCGAAGCTCCCGTTTATCCTTGGGAGTAAAAGAGTCTACTGTTCGGCGTGATGAGTCGGATCTCGGAGGAATGTTTACACTCCTGGCAAATGCCGGAGAATTTCACGGAGAAAATCCACTCCGCGCCCTCCCCTCTTTGAAACGAAAATCACCCGAAATGACGTACCTCACTACGGAAGAAATCGCCAAATTGCTGGATGCAGTAAGCGGTGATGCTCGGCGGATTACGCTACTTTGTCTCAGTACTGGGGCGAGATGGGGAGAAGCGAAAAATCTGCGCGCGGAACACATCATCAATAATCGCGTGACGTTTAACAAAACTAAAAACGGAAAAGTTCGAATTATTCCTGTCTCTGATGAAGTTGTTAGTGAGATCAAAACAAAGAAATCCGGCCTTTTGTTTGACGTCAATTATGAGGAATATCGCAAGGTGCTTCGCAGTGTTAAGCCAGACCTACCAAAAGGACAGGCTGTACATGTTCTACGCCATACCTTTGCTGCTCACTTTATGATTAATGGAGGAAATATACTTACGCTCCAGCGAATTATGGGGCACGCCACGATCCAGCAAACTATGACCTATGCGCACCTCGCTCCTGATTTCCTCCAGGATGCAATTTCACTTAATCCGTTAAAAGGAGGCATCCACATTTCATCCACATAAGTGGGTTTTATAGGGTAATCAGTAACCCCCACCAATAACAAAACCCACTGAAAACAAAGGGAAAACATTGAATTCAGTGGGTTTTACAACGCA

325

103,658

1,021

1,521

Lf500

500

BASEL

virulent

1

BASEL__Lf500__103658__1

500

ATATATTTTTTCTGGGTATGCAGGAGATTGGTAAAGAACGTTTACGTTATCTGGTAGTACGCCTTTTTTACCTGCGAAGCCACGAATATTAGAACTACAAACATAAAACCAATCATGGCCTCTACCAGCAGAACCAATAGGCGCCTGCCAGTTAGGTTCCCAATAATCTGCGTTACCACCATCTAAAGGAACAGTAGAGACACCAGTTGGAAAACCCATAAGACTCCAGGCTCTGGCAATGGCTTCACCAGCAGAAACACCACCAGGTCTAAAGATCTGGAAACCAGAGGACTGTAGTAAACTGCCTCCAGAACCTTGCCTAGCAATAGATTCCTCATGACCAAGACCACCATTATAGATATAAGTACCATGAGCTAAACTATCACCGATCGCAAAAGCAGATGTTACAGATAATTCAGCACCAGCACGTGGTGGGTCTTCAAAGAATGATAAGAACTGGCCAACCTGAGATTGAGTACCATTCAGAAATCCACGATGAG

326

249,077

32,141

33,141

Lf1000

1,000

BASEL

virulent

1

BASEL__Lf1000__249077__1

1,000

TTTTTCTTCAGCTTCACGTTTTTTCTTTGCTTCAGCTTCTTTTGCTGCTTTCTTTGCAGCTTCTTCTGCTTCCAGTTGTTCTGGAGTTTTCTCTTTAGCCATGATTTAAATCCTCACAGTGTGGTTATTGGTTGTGAACTACGTTTTAAGTGGTTGCACTATAACCCCTCTAAAAGAACTATGCAATATTTTAGTTAATTAATTTAAGCCACGTTCCTTTACCCAGACCCCTAATGTATTACTTGATGTATTACGCTTCACACCTTGTGCCTCTAAACGATCCATTATTTGTTTTCTGAGCTGTAGGATTTCCTTCTTGTCACGAGGTTCACCAGCTTCTTTCCACATTTCGTCAGCAACAGCGAAAATAATATCGCGAGTGCCGGCTGTACGCGACGTTGCGGCACGTTTTTCGCTTGCCAGTGTGCTAGTACCTTGCCGCTCTCTTGTCGGTGTCCATGCCCCTTGTATGCCCATATTTGTTTGTACGGTTGGGCCGTCAATGATGGTGGATTCCAATGAACTATCATTCCGTACTTGAATATTAGGCTCCTCCCCCAAATCTGGAACAGAGCTACCTTCGCGGTACATGCACTCACCCTCTTTATTACTAGCAATTGCCCAGTCCGCTTGTTCAGCCACATCCGCATCTATTACTGTCTCCGGTATTTCATTTAAAAAGTAATGGATGATCTTACTGATCATTTTCTTTGGATATAAAGCACCTTGCTTATTACCCGTTAAGTTGATGTACAAAAGTTGCATTTGCACATCATCAAACTCTTTATGCAGTTCTTCAACTTCTAACGGAAGAACTACAGAACTTTCGCTACAGCATAGAATTCCATACTCGTGAAGACGTTGGAAGTTTGGATGCTTAGCTAATATCTGCATCCGATCATAATCAATTAAGACGTACATGTTAGTCCTTCCAATTAAAATTAAAACGGTATGTCGTCATCAAAATCTGGTGGTAGTTCTTTACCGTTACCAGTAAGAA

329

265,241

101,064

102,064

Lf1000

1,000

BASEL

virulent

1

BASEL__Lf1000__265241__1

1,000

AGATTTTACCCGACCGATTGGAGAGAAGCGTTTCATACTGCGTTCACCGAGAACCATTTTAACGCGATTCATGATATACGGAACGTCAAATCCCTCAATATTCCAACCAGTAAAAATAGCAGGTCGTTTCTGTTCCCAAAGATTGATATATTCCATGAGCATATCGCGCTCATTATCGAATGGCATATAAATTACTCGGTCAAGAATTTCTTGAGGAACTTCATCACCACCTTCACAGTCAAGCTTAGCAGCTAACTTTGCATCCCATTTTGATACTGAACCGTACATTGAATTCAAAAGGTCGAAAACATAAAAACGATCATCAATTGAATCGTAATGAGTGATAGCATCAATTTCATATTCAGCTTTCATTGGGTCAGGAAATTTATCACCAGTAACCTCAATGTCACAGTTAGCTACACGAACAAATTTTCGGTCATAAACAATTTCCGAACCATATGTATCACTGATATAAGCGAGTTTAAAATCGTTCATACCGAGAGCTTCGAGACCGATGTCTTCCATTCGTTTCATCCAATCTCGAGCATCTTTCATTGATGGAAATTTTTGAGGAGCACAATTTTTACCATAGATGTCTTTGTATTTTGACTCTTCCTTACAATGCCTAAACATAGTCGGAAGATATTCTACTTCACGAGTACGTTCCTTTCCGTTTTCATCAATATAACGTTCAACAATGTTATTTCCGACTGTTTCAATAGAGATATAAAATTCTTTCATAGATATTCCTTAGTTTATAGCCCGAGTTATTAGGCTCTTGATATATTATACTCCAATTAAGGGGCCGAAGCCCCTTGCTTAATTACCAATCGTATATTTAGGAACGAGTTTCCATTCATGTTTTTGTTTAAAAGAAATAACTCGGAAATTATTAGTTAAATCTTTCATAAAAGTTCTTTGACCAGGAACGATTTCAATCAGTCCCCAATCTTCTAACAACCATGCAATCGAATCACGACGAACTTCATCTTCTTCTGTC

330

321,968

66,884

68,851

Lf2000

2,000

BASEL

virulent

1

BASEL__Lf2000__321968__1

1,967

CTGTTACATGACGGTACGACGCGATCGCTGATCGCCTTAAACTATCGGTACAGTGAAAGATCCATACAATGGCTAGCCTTTCCCATACTCTTTTAAGGGGCACTAAATAAACGGGTATTAAATGAATAGGATGTTATACACGGGGCAATAACTGCACGGGATAGGGCACGGGAAAAGTGGAACGTTGAAAAAGAAGGTAAAGGCATTGCCAATACCCATTTTTTAAATGAGGACTCCCCCTTTTTAACAATTCGTCGCGGAGCGCCTAGCCCCACTCGGTCAAATCAGAATTTTAAACCCTTATATATAAGCATATGCCCCAACTTTATGTTGTGGATTTAAGCTTGAGGAACTATTTAATGAATCTAATTAAAGTGTTTAGACGGATGAAATGTAAACACGATTACTATCTTCTTCGTAAAGCTTACGGGGATGAAAGAATACACGGTCTCTATCTATCAACATGGAAATGTAGGGAATGTGGTAAGTTAAAGTTTAGTGAATGGATAGACAGACCGGGATGATAGTGCCTTAACGTGACATAGCCTTTATGAAGTCCCCTTTATGACATGCCCTTTACTTCAGCGTACACGGGTTGTTAGTATGAGGGTAGTCATCAGAGATGACATGGCCTTTACGGGTAGGTCTTATGATGTGCCCTTTATACTTCAGAGACAGCTACTACGTAGCGTCGTATTCAGAGGAGAAGAATTATGAATTTAGTATTAGACTTTTTATCAGAGGTTGTGCCTCGCTTTCGTACGGAGACTTGTGCCTTCGTTAAAATATCCCCTGAAGAATTAGAATGCATTGGTCGTCTGGTTGACTTGGATGACGATGAAGAATTTGATGCAACGATGGAAGTTAGTAGCCTAGGATGGTTATTCTTCCGAGCGTTCACCACTATCAAACCACACACTTATAAGGAATACTAATTTATGTTAGATTGTAAATATCAAGGAGATGATATGTTAGATTTAATCCACACTACTCGCCCTAATTCTAAAACTAAAACACAACCATCTACTCTGGAAGTAATTGAATACGAATCTACTAAACATGATCACCTCCCTGACTATGCTCGTGCAATGATTGAGATGATTGAAGAAGCTGAATATGAAATGCTCCATGATTACATCACCTCCAAAGATGAATGGCATCGTGATGTTCGAATCGAAGAAGATGGTACAGAAATAATTACGTGGGTTCACAAGAGTGAGTTAGTAGACGACGCACTGCGAGACTACGAAAAATTTTTGGTCGACGGCTCTATTCTTTTAGAGGAAGAGAAGGGTGTAGAACTTCCGTGGGAGGGTGAGACAGTTGCTTTAGGTAAGATGTTTAACCTGTCCGTTGGTGATTGTAAGTAATGTTTGCCTCCTTTGGGAGGCTTTTTGTGTTGTTGATAATGTAGAAGGAGTATAAAATGTTTGGAGAAAAAGGAGAACTCACACCTGCACAGGTAGCTGAGATTACAGGAAGATTACCCGGAGTAACGGAAGAACTTGAATCCAAGGGTATGAACCCAAGCAATGGGAAGTTTCAAAAGGGAAATAAATTCGGACGACCCAAAGGTAGTAGAGGTAAACTGACACAATTAATGTTGGACCGTGTTGCTGCAAGTCATTTGTCTCCTGATGAAGTGTTAATTCAAATTTACGAAGATCCTAATATTCCACCTGATCTTAGATTCAAGGCTGCATCAAAAGTTGCAGATCTGGTATATCCTAAGGCGGCCTCTGTTGAAGTTAAGATTGAGGAAGAGAATGTAGTCAACGAAGAATCACTGAATGCACAAATCAAGGACTTCTTGACTGGAGCACTTGGTATCGACGTTATGCCTCCAGAAGACAACTCCGAGGACGCTGAAAAGGGGGAGGAAGCGGACGAGAGTTAAGTAAAGGAAAGAAGGGGAGGTTCTTTGACGAAGGGACTTTCCCTTTTCTATTTTTTAAACTGGAGGAAGT

333

177,442

11,501

12,001

Lf500

500

BASEL

temperate

0

BASEL__Lf500__177442__0

500

AGCAGCACGCTTTTTAATCCATCCACCGGACCTTCAACCGGCCCTTCGCTGATGGCGTCTATCACGCTCAGCATCTGGGATGATTTCAGGTTGTCCTTCGCTTCGCGCGGGGTATGCCCCTTACTGCTGCCTTTACCCATTCCTCATGCTCCATAAACGATAAAACCGCCCGGAGGCGGTTTCACATAAAACATTTTGCATCAGCGACCAATCACCACAACCTGACCACCATCCCCTTCGTCTGCCGTGCTGATCTCCTGAGAAACCACGCGTGACCCCACGCGCATTTCACCGTACAGAACCGGCAGAACATTGCCCTGGGCAACCATGTTATCCAGTGAGGAGAAATAGGTGTTCTGTTTGCCGTTATCCGTTGTCTGTGTACGGGGAGTTCTGGCTTTCGGTGCCAGCATCTGCGCCACACCACCGAGCACCATACTGGCACCGAGAGAAAACAGGATGCCGGTCATACCACCGGCCCCAATGGCTGCCCCCCATGC

336

262,054

34,806

35,806

Lf1000

1,000

BASEL

virulent

1

BASEL__Lf1000__262054__1

1,000

ACTTCCTTCTCATGCCAAGAATAACGCCACAGCTTCTTGTGGTGGTCATATCTTCGCGTTACATCACCGTTATGAAACATAATGCGGATACGGCTTTTCACGATTCGGTAATCAATGCCAGTGGCTGCGCTGATTTCTTTCACCTCTGCACCAGAGTTATCAAGCAAATAGCACTTAATCGCATCATCAATGCCAGCTGCATCATCAGAGATGAAATATTTATACTGCCACTTCCCACCGCGAATCACGGACTTCTCGCGGCGAATGAAGCCAAGAGCAAGCATCTCGTGAAGACGATGCGTTGTGGTGCTTGAATGTTTTCCTCCGCAATGCTTCTCAATATATGCGCGCGTTGCGCCGGGATGATTGACAATCACGCGCATGATTTGTGATTTATAGTCCATAATCACGCTCCTCTGCTGCCTGATTGAAGTCGTCGGCGGTGTAGAGGTGTCCGCCCCTTGTGTTCCATTGGGTGGCCGCAGCCAACTTCGTTACGTGAACATCACTTGAGCATCCGCACTCACACATGGCGAAATACATACCATCATCGTTATATAATTTAACTTCGTGGCTGCCGCAAAAAGGACACTCAAGCAGCATTTCATCATTCATCATCGGCATATGTGGTGCGCTCATTTTGTCATATCCTTAAGTATCTTATTCATGTTTAACTTGCACAGTCTTATCAAAACTCGGTCGCGCCGGTATCTCCACTCCTTTTTGCTACGCATCGATTGCTTAAGCAGAGTGCGAAATGTAATATCCTGCCTCTGATTTCTTGACTTCTTGTTTCTGGCGTTAGACTCGCTGATGTCAGCGAAAATCAAGTCAACTAACGTGCTGAACTTTCTCATTTTAACCATTCCCCTAAGTTGTTAAATTTAGGTGCGTCACCTGACCAGTCGATAACATCTTTCTGTTGACTGCGTTTGCGTTGCAGTCGATTGCGCACCTCTCGCAATTCGCACTCCAGCCATTCGCGAGCACGCTCAACTTC

340

245,882

36,457

37,457

Lf1000

1,000

BASEL

virulent

1

BASEL__Lf1000__245882__1

1,000

GAATTTTTATGGAGATGTATTTGCGGAAACATGGCAACTATAGAGTATAGATATCCTGAGGTAAAACAGTATGTGTGGGCATACCCGCAAGTAATGTCTGACAGCATCACTGTTACCGCTAGAGATTCTACCGTGCTTCATATGGGGCAGGTTGCTCTGAAAGGGTATGTAGAAGATGTTGTCCCGCCAGACTTCTCATAATCAGGAGATAAAATGTCAAAACCTAGTTTTCCATTAGAGATTTGGGCAGAGGAGGATCAGGTTCTGCCTAACACCCACAGACAGAACAGGCTACGCCCGATTGATGATTTGTGGAGAAAAGGTTGGGATCTTGGTCAAAAGCCCTCATGTGAAGAACTTAACTATATTTTCAATATGCTCGGGACTTGGGCAAAATACATTGCTGACGAGCAGATCCCAGCTCAAGAAGGCCGTTATCTGGTACGTGATAATAACTTGAGCGATCTTTTGAACATTCCTGTTGCCCGTAGAAACCTTGGGATTATCACTAAGGAAGAGGCAGACGCCAGGTATGTAAAAGTTACAGGTGATACAATGACAGGCCCCTTGGGGTTGCAACGTATCAACTTTAAAGCTGCCGAGACAGATAAGGCTTGGATAGAGACAACTATTGGCCCAGATAAGACAACCCTCGACTTTGGGTTAAGTGATAATACCGGGTCGTTTGATGATGGTGGTACATCTACAGTAGATGCGTTTCGTTGGAGATTCCAGCCAACTCAGCCGGATATTAATCCAGAGTTCACTTTGATGTACCTTAACGCGATCACGGCTAATCGTGCGCTGTTGAAAGTGGTAGGCAATGTTGAAGTTGTCGATAACATGAGGTGCAATAACCTTACTATCAGCAATACAGCAACATTCACCAACTGTAATGTGGCCAGTCAGTTGACGGCTGGGTCAGTATATGTTAATGGTGGTGCAAGTTGTGACAGTATGGTTGTAAGAAGCCAGCACTGTGTTGTCGGTAACAGAAATG

341

95,556

89,289

89,789

Lf500

500

BASEL

virulent

1

BASEL__Lf500__95556__1

500

CATCTGGAGAAAGCAGTTATCGTAGTCCTGGTGTTTGTGGGTGTAAAACTGATGTATCACCCGTTTGCAGAAACTCTGCACGCAAAAGTCAGTTTCCTGCCAGCACACATTGATCCGACGATCAGTATGTATATTGTGTTAGGTACTCTTGGGCTGGGTGTTATTGCAAGTTTAATCTTCCCTGAAAAAGAAGACCAGACTGTTGCTTAATTCATTAAGCCCCTTCGGGGGCTTTGTTGAGGTGATCTGATGGTGGTTTTACGTGTTCTTTGGATTCTGTTTGAAAATATTTGTTTTGCTTTAGGGTTATTTTGTTTGATTTTTATCTTGACAACATATATTGATAACCATACAATTACTATCAACAGGAACGGAGAACAGATGTATTGTTTCTCTAGGGATTTTAAAAATTGTGAGACTTTAAATGAGAGGGTTACAAATGAAAAACATTAAATCTTTTATTGTTGCAGTTGTATTAGGTAGTGCATTGCTGGTAGGTT

343

264,114

51,232

52,232

Lf1000

1,000

BASEL

virulent

1

BASEL__Lf1000__264114__1

1,000

TAGCTATTTTGGTAAAATGAGCTTCGTACTCAAATTTAGTATCTGGGGCTACTTTCTCTCTTACGTCCAAATGGTGACTATTAGTAAGATAGCCTTTATCTGTTAACCAAGAATACTCTGGGAACCTACGTTCTAGTAATTTATTAAAACGATTACATAGAGACTCACTAGGAGTAGCATACAAGCTAAACCCAAGATTAGTCTCATTAGCTTTAACTTCGCAACGATTTTTTAGGTGAGTGAGAACTTCCTCTGTAAATTCAATACAATCCCTATGGGTTTGTGGTAGACCAAACATTATTTGGCACATCTCATAGACCCCAATGTATCCAAGAGATACAGAAGATCTACCCTCAAAAATAGGCCATACATACTCTTCCCCATCTAAACGCACACCAAAACCCCCGTGCATATAAAGAATAGGGGCTTGTTTAGCCTTCACTTTCTTAAGTCTATTTAAGAAAAAATCATGAGCTTCAAAAGCCTCATCCACATATTTGTCCAGAATATCCCAGAAATCTTCAAAAACCCCATCTGCCTCAGCAGCAACCATAGGTAGATTAATAGACACTACACCTAAATTATTGCGCCCTGCAATTTCTCCGGAGGGGATAGCAGATAAAAAGCTACGACAACCCATAGGTGCTTTAAAATCACCAGTAACAGCTACAACTTTCTCGTAACTTAAATAGTCCGGGTACATACGGGTAGCAGAACACTCAAGTGCTAGCTGTTTTATATCGTAGTTAGGGTCGCCTGGATTTTTATTTAACCCTTCTTTAACTGAGAATACTAGTTTAGGGAAGATAGGGGTTGACTCAGCAGCACCTAAACCTTTAATACGGTTTTGGAGGATGGCTTTCTGAATCATCCTTTCCTCCCACCCCTGTCCTAGCCCAAAGCCAAGCGTAACAAAAGGAGTCTGTCCATTAGAGTTAAATAATGAATTAGTTTCATACTCTAGGGCTTGGAATGCGTCATAACACTCTTTTTCAGTAAG

345

286,522

4,799

5,799

Lf1000

1,000

BASEL

temperate

0

BASEL__Lf1000__286522__0

1,000

TTGAAGCGACTGAGGTATGAAGTGTGGAGTTGATTTCAGCTGGTCACACCGACGTTCACGCGTCCGCTTCACCCCTCGCACTTCCCGTAGCCTGCTGAAATTCAAGCTGCGGATCTAAGCGGTCATCGCAACGGTGAATCAGGTGGTTGCCGTATCGTTGTGTTGTTGCGACATGGTGATAATAGCTATTGCTATTGGTGATATCAATACTTATAGCTATTGATTGATGTGTTTTGATATTAACTGTTTGATAGCAAAAAGAATTAATTTTGTGACTTGCATCGCATAGCGATAACTGAAGGGAGGTTGTGGTGGTTTTTCGAACGGTTTGTGTGATGAGGGGAGGGGACAAAAGAAAACCCGGCACGGTGGCCGGGTATCTTTATTCGAATGGAAGATCTATTTGCCTTTGAGGATTCAACTGTTTTTTTACATGCTCAATTTCGAATATGGTTTTTATGGCATCTCCGATCATATATTGAGTTACTTTTAAATCTACAAGTAACATATCACCTTTAGAAAAATTTAAGGTGTTGTTATCAATATCGCTGATGAATTTCTGGTCTTTTATTTCAGCCAAAAAGCTACTGGCACCATCAGAAAACCGCCACCGGCTTCCTTCATTGAAGGAAATATTTTTAATTTGAAGGGCTTTCTCTACTGTGTACTCTGAAATTATTGATTCTGCTGGTAGATTGACTTTGAAATAATGTGCTTCTTGCTTGTTGATCGTCATGAATGTCAAACCATCATCGACAGTAGAGGCAAAGCTGTCAATGCCTTCCTGCTCTAATGGCTTACTTATAACTTCTTGTAATGAAGAGCGAAGTTTAATATTTTTATAAAGTTCAATAACGTTACTGTCGTAGATCTCGCTTTCGTCATCAACAAAGACTTCGATGTTGCTATCAGGCAAATTGTGTAATTTTTTTATTTTCCTTGGGCCTATCCATTTTATCAGTTGAATTAGGCCTTTGCATATTTTTTCTTTAGAACCAGG

346

324,541

46,273

48,273

Lf2000

2,000

BASEL

virulent

1

BASEL__Lf2000__324541__1

2,000

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

355

164,310

13,476

13,976

Lf500

500

BASEL

temperate

0

BASEL__Lf500__164310__0

500

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356

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108,388

Lf2000

2,000

BASEL

virulent

1

BASEL__Lf2000__326846__1

2,000

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357

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42,778

Lf2000

2,000

BASEL

virulent

1

BASEL__Lf2000__321879__1

2,000

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359

142,615

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121,503

Lf500

500

BASEL

virulent

1

BASEL__Lf500__142615__1

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360

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129,376

Lf500

500

BASEL

virulent

1

BASEL__Lf500__151201__1

500

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363

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24,236

25,236

Lf1000

1,000

BASEL

temperate

0

BASEL__Lf1000__285918__0

1,000

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366

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21,534

Lf2000

2,000

BASEL

temperate

0

BASEL__Lf2000__341586__0

2,000

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369

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39,290

Lf2000

2,000

BASEL

temperate

0

BASEL__Lf2000__340108__0

2,000

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370

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2,980

Lf500

500

BASEL

temperate

0

BASEL__Lf500__171371__0

500

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371

360,802

12,553

17,553

Lf5000

5,000

BASEL

virulent

1

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5,000

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